Ambas facturas tienen los mismos efectos fiscales, no obstante, las Facturas Electrónicas cuentan con elementos de seguridad basados en estándares internacionales, lo cual le proporciona mayor seguridad que las facturas tradicionales.
Además son más versátiles ya que son creadas, enviadas y almacenadas por medios electrónicos y se pueden imprimir las veces que sea necesario.